Proteazy serynowe i ich klasyfikacja według systemu merops*

Abstrakt

Enzymy proteolityczne inaczej nazywane także proteazami, proteinazami lub peptydazami są to enzymy należące do klasy hydrolaz, które posiadają zdolność do hydrolitycznego rozkładu wiązania peptydowego, czyli proteolizy . Enzymy te zostały zidentyfikowane zarówno w organizmach prokariotycznych jak i eukariotycznych. Wykazano, że typowy genom ludzki zawiera około 2% genów, które odpowiedzialne są za kodowanie enzymów proteolitycznych. Proteazy serynowe stanowią prawie jedną trzecią wszystkich enzymów hydrolizujących wiązanie peptydowe. Nazwa tych proteaz pochodzi od obecności nukleofilowego aminokwasu seryny, znajdującej się w miejscu aktywnym enzymu, która atakuje grupę karbonylową wiązania peptydowego tworząc produkt pośredni reakcji tzw. acylo-enzym. Ze względu na to, że reakcje katalizowane przez proteazy są bardzo złożone, Rawlings i Barrett zaproponowali bardzo precyzyjny system opisujący klasyfikacje enzymów proteolitycznych - MEROPS. Według tego systemu proteazy są podzielone na klany, w których następnie wyróżnione są rodziny. Najnowsza baza MEROPS podzieliła proteazy serynowe na 15 klanów, w których znajdują się łącznie 53 rodzin. Celem tej pracy jest krótka charakterystyka proteaz serynowych oraz ich podział na poszczególne klany.